Balıkesir Üniversitesi’nin 1992 yılında kurulmasından sonra büyümeye başlayan üniversitemiz  bu gelişme doğrultusunda ilçelere açılmaya başlamış ve 1994 yılında da Erdek Meslek Yüksekokulumuz yanda ilk hali  görülen binasında iki program (Turizm ve Otel İşletmeciliği-Yerel Yönetimler) ve 60 öğrenci ile eğitim öğretime başlamıştır. Daha sonra bu programların II.öğretimleri de açılmış ve öğrenci sayısı yaklaşık 400’ e çıkmıştır. 2005 yılında onarılan mevcut binasında eğitim-öğretime  devam eden Erdek Meslek Yüksekokulumuz, halihazırdaki bu  yerinden 2007 yılında  üniversitemize tahsis edilen sahildeki yeni yerine 2008-2009 eğitim-öğretim yılı itibariyle taşınmış olacaktır.